Le chlorhydrate de vancomycine est dérivé du composé naturel vancomycine, isolé pour la première fois de la bactérie Streptomyces orientalis dans les années 1950. Il est principalement utilisé pour traiter les infections bactériennes graves causées par des organismes à Gram positif, notamment le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) et les espèces d'Enterococcus.